質粒存在于許多細菌以及酵母菌等生物中,是細胞染色體外能夠自主復制的很小的環狀DNA分子。在基因工程中,質粒制備可將質粒作為目的基因的載體,在新的宿主生物體中正常表達。質粒DNA可以作為疫苗或治療性藥物單獨使用,或在病毒載體生產中作為病毒包裝的原料。
質粒制備的步驟
質粒制備流程圖
質粒制備常見問題
Q:轉化后克隆數量少
A:可以設置陰性和陽性對照。克隆過程中,陰性對照-空載長出菌落,判定可能是酶切不完全導致,陽性對照不出斑,可能是轉化實驗的操作出現問題。感受態細胞切勿反復凍融,且熱激時間一定要精準到秒,同時正確使用抗生素或其他篩選標記。
Q:菌落太多但假陽性率高,挑不到正確克隆
A:菌落PCR鑒定引物需跨區域設計,一條引物設計在載體上,另外一條在目標片段上。如此可避免假陽性克隆又篩除反向插入片段,還可以通過提取質粒酶切跑膠進一步排除錯誤克隆。
Q:大腸桿菌老化
A:建議涂布平板培養后,重新挑選新菌落進行液體培養。
Q:質粒未全部溶解
A:洗脫溶解質粒時,可適當加溫或延長溶解時間。
Q:質粒提取不成功
A:裂解時間過長,一般不應超過5分鐘。吸附時間,溶解時間不夠都會導致質粒DNA提取實驗失敗。
質粒制備|泓迅生物
泓迅生物擁有完善的質粒制備生產線,確保提供無RNA污染、無基因組污染的高質量無菌質粒,可將內毒素含量控制在較低水平(< 100EU/mg、<30EU/mg、<5EU/mg,供選擇)。另外我們還提供序列驗證、限制酶酶切和內毒素分析等服務,滿足各領域客戶多樣化的下游應用,如轉染、抗體制備,疫苗和基因治療研究等。
案例分享——轉染級質粒制備
將質粒轉化后挑取單克隆菌落進行培養,抽提菌液進行酶切及測序驗證,對符合要求的質粒進行大批量接菌抽提,之后對各批次抽提質粒進行酶切驗證,無誤后混合所有抽提質粒,最后對大抽質粒進行去內毒素處理,48h細菌檢測如圖1所示。
圖1 內毒素檢測
內毒素檢測結果為陰性對照不凝固,陽性對照凝固,測試稀釋樣品不凝固,標準品不凝固,證明去內毒素處理成功。
經過細菌檢測結果比對,48h無抗培養基均不長斑,通過無菌檢測。