微生物細胞工廠示意圖
01
微生物細胞工廠的基礎概念
微生物細胞工廠是指經過基因組工程或代謝工程改造的微生物菌株,通常是細菌或酵母等單細胞生物。它們在實驗室中經過人工精確設計和改造,使其具備特定的功能或產生特定的產物。科學家們通過定制化設計微生物,使其成為高效的生產工具,應用于藥物生產、化學品合成、能源生產、環境修復等領域。
微生物細胞工廠示意圖
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微生物細胞工廠構建全流程
構建微生物細胞工廠不僅可以提高生產效率,還可以降低生產成本,為工業生產帶來革命性的變革。以下是微生物細胞工廠構建的全流程:
1. 路線設計:根據期望獲得的功能或產物設計生產路線。
2. 底盤細胞選擇 :確定需要改造的微生物,選擇一個性狀優良的底盤細胞,也就是用于改造的宿主細胞。
3. 代謝途徑重建:通過設計、構建、驗證策略來設計代謝途徑。新興基因編輯、合成工具加速生產宿主中代謝途徑的構建。
4. 耐受性增強:對初次得到的菌種進行持續的篩選、優化,通過理性或適應性實驗室進化 (Adaptive laboratory evolution ,ALE)來增強菌種的耐受性。
5. 代謝通量優化:運用DNA測序、基因合成與組裝及基因編輯等技術加速代謝通量和代謝載量的優化,使目標產品的生產效率最大化。
6. 發酵:發酵過程與菌種開發同步進行 提供數據反饋 。
7. 產品回收和純化:根據產品特點選擇合適的純化路徑,并且優化純化條件。
8. 放大:根據回收和純化的數據對代謝通量進行反復優化,以實現從實驗室規模到商業化生產的放大。
Systems Metabolic Engineering Strategies: Integrating Systems and Synthetic Biology with Metabolic Engineering
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微生物細胞工廠構建的技術方法
微生物細胞工廠構建過程中涉及多種常用的技術方法,主要包括基因合成、基因編輯、代謝工程和蛋白工程等技術:
基因合成
基因合成技術可用于構建合成新的代謝通路、調控元件或功能模塊,為微生物的功能增強和新功能引入提供基礎。
基因編輯
利用CRISPR-Cas9、TALENs、ZFNs等基因組編輯工具,對微生物的基因組進行精準編輯,實現目標基因的敲入、敲除或修飾。可用于改變目標菌株的性狀、代謝途徑或生物學功能。
代謝工程
通過調控菌株的代謝途徑或代謝通路,可提高目標產物的產量、改變代謝產物的結構或選擇性合成特定代謝產物,從而實現對微生物的功能優化和產物生產的調控。
蛋白工程
通過改變目標蛋白的結構或功能,以提高其活性、穩定性或特異性,從而增強目標產物的合成能力。這涉及到蛋白質設計、蛋白結構預測、蛋白進化等技術。
高通量篩選
利用高通量的篩選方法,如微流控技術、高通量測序等,快速篩選和鑒定具有目標性狀的菌株。
系統生物學分析
利用系統生物學的方法,對微生物的代謝網絡和調控網絡進行建模和分析,揭示微生物工程改造的規律和原理。
構建微生物細胞工廠相關技術
這些技術方法相互結合,構成了微生物細胞工廠構建的核心技術體系,為微生物工程應用領域的發展提供了重要的技術支持。同時,隨著生物技術的不斷發展和創新,還會涌現出更多新技術和方法,為微生物細胞工廠提供更多的可能。
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微生物細胞工廠的應用領域
微生物細胞工廠在各個領域都有廣泛的實際應用,以下列舉了幾個典型的應用領域:
藥物生產:微生物細胞工廠可被用來生產各種藥物,如抗生素、生物素等,實現對目標藥物的高效合成,降低生產成本并提高產量和純度。
生物燃料生產:微生物細胞工廠可以將廉價的生物質原料轉化為高效的生物燃料,如生物柴油、生物乙醇等,有望解決傳統燃料資源的短缺和環境污染問題。
化學品合成:微生物細胞工廠可以實現對目標化學品的高效生產,如有機酸、氨基酸、醇類等,具有潛在的工業應用前景。
食品工業:微生物細胞工廠可以合成具有特定功能和營養價值的食品成分,如有機酸、醇類等,為食品工業的創新和發展提供了新的途徑。
環境修復:微生物細胞工廠可以被用來處理污水、降解有機廢物等,有望解決環境污染和資源浪費等問題。
微生物細胞工廠在藥物生產、生物燃料生產、化學品合成、食品工業和環境修復等各個應用領域都有實際應用,為解決人類面臨的各種挑戰提供了新的解決方案,具有廣闊的應用前景和社會經濟效益。
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結果展示: 在大腸桿菌中成功構建了3-羥基丁酸的合成途徑,并獲得了高表達的敲除菌株。
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References
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