研究基因在代謝通路或某些特定疾病發(fā)生過程中的功能，對于疾病機(jī)理研究及藥物研發(fā)具有非常重要的意義。新一代基因編輯技術(shù)CRISPR以其操作簡單和通用的獨(dú)特優(yōu)勢，成為開展正向遺傳學(xué)篩選實驗強(qiáng)有力的工具。利用CRISPR技術(shù)建立可能與某類功能相關(guān)的突變體庫，通過功能性篩選和富集、PCR擴(kuò)增及深度測序分析，確認(rèn)與這類功能相關(guān)的基因。
泓迅生物利用獨(dú)創(chuàng)的“GPS”（Genotype，Phenotype，Synotype）平臺，提供基于CRISPR sgRNA文庫的一站式基因功能篩選服務(wù)。我們專利的Syno?合成技術(shù)平臺，可以快速高效地實現(xiàn)sgRNA文庫構(gòu)建，并包裝成慢病毒混合文庫后轉(zhuǎn)染細(xì)胞。結(jié)合高通量/高內(nèi)涵篩選平臺，利用控制細(xì)胞存活、結(jié)合免疫染色、流式細(xì)胞術(shù)等手段篩選得到所需細(xì)胞，最終通過測序等方法推斷出發(fā)揮作用的靶基因。
| 服務(wù)項目 | 服務(wù)詳情 | 周期 |
|---|---|---|
| sgRNA設(shè)計 | 針對目標(biāo)基因群進(jìn)行sgRNA序列設(shè)計 每個基因設(shè)計3-6條sgRNA（無物種限制） | 1-2周 |
| 芯片合成 | 將所設(shè)計的所有sgRNA及陰性對照合成在一張芯片上 | 3-4周 |
| sgRNA文庫構(gòu)建 | 將sgRNA構(gòu)建到客戶的目標(biāo)載體上 | 2-3周 |
| 文庫質(zhì)粒大抽 | 根據(jù)發(fā)貨量進(jìn)行轉(zhuǎn)染級質(zhì)粒抽提 | 1周 |
| 文庫質(zhì)檢及NGS驗證 | 庫容量大于100x、覆蓋率>99% 文庫正確率>80%、文庫的均一性<5-10 | 2-3周 |
| 病毒包裝 | 病毒滴度>108TU/mL | 2-3周 |
| 文庫細(xì)胞pool構(gòu)建 | 覆蓋度高達(dá)99%、支持任何癌細(xì)胞系為目的細(xì)胞的構(gòu)建 | 6-9周 |
| 高通量篩選 | 正向篩選實驗、反向篩選實驗、 藥物抗性實驗、報告基因檢測 | 2-3周 |
| 基因功能分析與驗證 | 文庫QC、樣本相關(guān)性、目標(biāo)基因分析等 | 1-2工作日 |
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